UUSI PUNKKI-VIRUS LÖYDETTY KOTKAN SAARISTOSTA

[Jatta1001]

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articl ... iZzzG5gnrk

Uuden punkin välittämän taudinaiheuttajan, Alongshan-viruksen, havaitseminen Ixodes ricinus -punkeissa, Kaakkois-Suomessa, 2019
Suvi Kuivanen, 1,8 Lev Levanov, 1,8 Lauri Kareinen, 1 Tarja Sironen, 1,2 Anne J. Jääskeläinen, 7 Ilja Plyusnin, 2 Fathiah Zakham, 1 Petra Emmerich, 3,4 Jonas Schmidt-Chanasit, 3,5 Jussi Hepojoki, 1,6 Teemu Smura, 1,7,8 ja Olli Vapalahti1,2,7,8
Tekijän tiedot Artikkelin huomautukset Tekijänoikeuksia ja lisenssejä koskevat tiedot Vastuuvapaus
Tätä artikkelia on siteerattu muissa PMC: n artikkeleissa.
Mene:
AbstraktiÄskettäin tunnistettu puukkien välinen Alongshan-virus (ALSV), segmentoitu Jingmen-virusryhmän flavivirus, yhdistettiin äskettäin ihmisen sairauteen Kiinassa. Raportoimme ALSV-RNA: n havaitsemisen Kaakkois-Suomessa Ixodes ricinus -punkeissa. Jingmen-punkkiviruksen kaltaisen viruksen RNA: n ja vasta-aineiden epäilyjen vuoksi punkin enkefaliitista epäiltyjen seerumien seulonnassa ei havaittu ihmis tapauksia. ALSV: n esiintyminen tavanomaisissa eurooppalaisissa punkeissa vaatii lisätutkimuksia sen roolista ihmisen taudinaiheuttajana.

Asiasanat: Alongshan-virus, ALSV, Jingmen-punkkivirus, flavivirus, Ixodes ricinus
Viimeaikaiset raportit ovat liittäneet Jingmen-virusryhmän kaksi jäsentä, Alongshan-viruksen (ALSV) ja Jingmen-punkkiviruksen (JMTV), kuumeiseen tautiin ihmisillä [1,2]. Tässä kerrotaan ALSV: n esiintymisestä ja geneettisestä karakterisoinnista Ixodes ricinus-punkissa Kotkan saaristossa Kaakkois-Suomessa.

Vuonna 2010 Kiinassa Hubein maakunnassa Rhipicephalus microplus -punkeissa havaittiin uusi segmentoitu punkin välittämä RNA-virus, JMTV [3]. Myöhemmin Brasiliassa R. microplus karjassa ja nautaeläimissä on tunnistettu samanlaisia viruksia, ts. Mogiana-punktivirus (MGTV) [4-6]; ihmisten Krimin ja Kongon verenvuotokuumetapaukset (CCHF) Kosovossa * [7]; Amblyomma javanense, Dermacentor silvarium ja I. persulcatus -puikot sekä ihmiset Kiinassa [1]; ja punainen colobus-apina Ugandassa [8]. Viimeaikaiset raportit yhdistävät Kiinasta peräisin olevat uudet JMTV-kannat ihmisen sairauteen [1,2]. Jia et ai. ilmoitti JMTV: n tunnistettavan kuumepotilaiden ihon biopsioista ja verestä [1]. Samaan aikaan ALSV havaittiin I. persulcatuksesta ja eristettiin kuumeisista potilasseerumeista Heilongjianin maakunnassa [2]. Nämä virukset jakavat neljän segmentin genomijärjestelyn, joista kahdella on samankaltaisuus kuin Flavivirus-suvun segmentoimattomien RNA-virusten NS3- ja NS5-proteiinien kanssa. Kaksi muuta segmenttiä näyttävät olevan peräisin tuntemattomalta esi-isältä. Yhdessä virukset muodostavat erillisen ja monipuolisen ryhmän, jota alustavasti kutsutaan Jingmen-virusryhmäksi perheessä Flaviviridae [9].
Mene:
Jingmenin kaltaisen viruksen havaitseminen Kotkan saaristossa
Vuonna 2019 suorittaessaan Kaakkois-Suomesta Kotkan saaristosta Haapasaaresta vuonna 2011 kerättyjen punkkien metatranskriptista analyysiä havaitsimme JMTV: n kaltaisen viruksen täydellisen genomin yhdessä punkin enkefaliitin viruksen (TBEV) kanssa. Sen jälkeen käytimme RT-PCR: ää 198 I. ricinus-punkin seulomiseksi Kotkan saaristosta vuosina 2017 ja 2018 JMTV: n kaltaisen RNA: n esiintymiseksi. Löysimme toisen positiivisen punkin Kuutsalon saarelta Kotkan saaristosta ja saimme täyden genomin seuraavan sukupolven sekvensoinnilla. Virukset (GenBank-tunnusnumerot MN107153 - MN107160) klusteroituvat yhdessä ALSV: n (MH158415 - MH158418) kanssa Heilongjianin maakunnasta, Kiinasta, ja muodostavat klusterin, joka eroaa muista jäsenten JMTV-ryhmästä, mukaan lukien Kosovosta löytyvät kannat (MH133313 - MH133324) [2 , 7] (kuva 1, kuva 2, kuva 3, kuva 4, kuva 5). Nukleotidi- ja aminohappoidentiteetit suomalaisten kantojen ja muiden punkkien välityksellä esiintyvien JMTV-kaltaisten virusten välillä on esitetty taulukossa 1. Viruksen eristämiskokeet Vero, SK-N-SH- ja CRL-2088 -soluissa epäonnistuivat.